Pavardė „Juknius“ yra lietuviška, kilusi iš asmenvardžio Jukna (dažniausiai trumpinys nuo Jokūbas). Gali reikšti „Juknos sūnus“ arba būti susijusi su žodžiu „jukti“ (tampriai judėti, krutėti). Žymiausias jos turėtojas – Hansas Juknius, vokiečių fizikas ir filosofas, žinomas dėl kvantinės mechanikos tyrimų.