Pavardė „Zokaitis“ yra lietuviška, kilusi iš asmenvardžio „Zokas“. Pastarasis greičiausiai atsirado kaip trumpinys iš „Zacharijus“ arba „Izokas“. Tai patroniminė pavardė, rodanti sūnų ryšį su tėvu vardu Zokas.
Istorijoje žymiausias šios pavardės asmuo yra Petras Zokaitis (1843–1920), vienas pirmųjų profesionalų lietuvių teatro režisierių ir aktorių, reikšmingai prisidėjęs prie sceninio meno Lietuvoje.