Lietuviška pavardė „Vitkūnas“ yra kilusi iš asmenvardžio Vytas (reiškia „vadas“) ir priesagos -kūnas, galbūt susijusios su žodžiu kūnas („kūnas, asmuo“). Tai gali rodyti giminės ryšį su žmogumi, vardu Vytas.
Žymūs žmonės su šia pavarde:
– Marius Vitkūnas, Lietuvos archeologas, Vilniaus universiteto profesorius.
– Arūnas Vitkūnas, Lietuvos diplomatas, buvęs ambasadorius.
Pavardė dažniausia Lietuvoje, ypač Vilniaus ir Kauno regionuose.