Pavardė „Raudonaitis“ yra kilusi iš žodžių „raudonas“ ir priesagos „-aitis“, nurodančios kilmę ar priklausomybę. Ji gali būti susijusi su vietovardžiu (pvz., vietove, kurios pavadinimas siejasi su raudona spalva, dirva ar kitais objektais) arba charakteristika (pvz., žmogaus išvaizda ar veikla). Lietuvoje ši pavardė siejama su istoriniu veikėju Raudonaičiu, minimu XIV a. kryžiuočių kronikose kaip žemaičių kunigaikštis, dalyvavęs kovose su Vokiečių ordinu. Šiuolaikiniai žmonės su šia pavarde – politikas Kazimieras Raudonaitis ir krepšininkas Marius Raudonaitis.