Lietuviškos pavardės „Modgabis“ kilmė siejama su asmenvardžiu Motiejus (Matas). Tai patroniminė pavardė, galimai susidariusi iš jo trumpinių arba šnekamosios formos. Pavardė gali būti išsivysčiusi iš variantų, pvz., „Motgabis“ (nuo Motiejus + gabenti?), vėliau supaprastinta iki „Modgabis“.
Istoriniuose šaltiniuose minimas Mykolas Modgabis (m. 1686) – Žemaičių vyskupas (1677–1686), vienas žymiausių šios pavardės nešiotojų. Jo vardu pavadinta gatvė Kaune (M. Modgabio g.).