Pavardė „Mickonis“ yra lietuviška, kilusi iš krikšto vardo Mikalojus (arba Mikas) trumpinių arba pravardžių. Tai patroniminė pavardė, reiškianti „Mikono (Miko) sūnus“. Lietuvoje tokio tipo pavardės atsirado apie XVI–XVII amžių.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Leonardas Mickonis – Lietuvos teatro režisierius, pedagogas.
Vladas Mickonis – Lietuvos ir JAV šachmatininkas, literatas.
Jonas Mickonis – tautodailininkas, liaudies meistras.
Pavardė dažniausia Lietuvoje, ypač Utenos ir Vilniaus kraštuose.