Kilmingos lietuviškos kilmės pavardė, kurią sudaro dvi dalys: priesaga „-aitis“ (reiškianti sūnų) ir galbūt susijusi su žodžiu „labūnas“ (tarmiškai – didelis, stambus žmogus arba gausus, turtingas). Taigi pavardė gali reikšti „Labūno sūnus“ arba per prasmę – „stambaus, gausingo žmogaus palikuonis“.
Istorijoje žymiausias jos nešiotojas – Mikalojus Labūnaitis (apie 1570–1640), vienas pirmųjų Lietuvos teatro kūrėjų, dramaturgas, Vilniaus jėzuitų akademijos profesorius. Jo kūryba laikoma svarbiu Lietuvos renesansinio teatro paminklu.
Trumpai: kilminga lietuviška pavardė, reiškianti „Labūno sūnus“, žymiausias atstovas – renesanso dramaturgas Mikalojus Labūnaitis.