Pavardė „Kunigiškis“ yra kilusi iš žodžio kunigas, nurodant, kad asmuo ar jo protėviai buvo susiję su kunigo pareigomis arba tarnyba bažnyčioje. Tai yra dviskiemenė pavardė, sudaryta iš šaknies „kunig-“ ir priesagos „-iškis“, kuri dažnai reiškia kilmę ar priklausomybę (panašiai kaip „-aitis“). Tokios pavardės atsirado LDK laikotarpiu.
Žymiausi asmenys:
Mikalojus Kunigiškis (apie 1475–1538) – žymus renesanso humanistas, filosofas, pirmosios lietuviškos knygos „Katekizmas“ (1547) autorius.
Jonas Kunigiškis (1884–1959) – Lietuvos karinis veikėjas, generolas, vienas Lietuvos kariuomenės kūrėjų.
Trumpai tariant, tai – kilmės iš kunigo šeimos pavardė, kurią garsina ypač renesanso mokslininkas Mikalojus Kunigiškis.