Tai lietuviška patroniminė pavardė, kilusi iš vardo Jonas (dažniausiai reiškia „Jahvė yra maloningas“). Ji nurodo „Jono sūnus“ arba „iš Jono (giminės)“.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Algirdas Janaitis – archeologas, istorikas.
Antanas Janaitis – rezistentas, politinis kalinys.
Justinas Janaitis – kunigas, visuomenės veikėjas.
Viktoras Janaitis – choro dirigentas.