Lietuviška pavardė, kilusi iš asmenvardžio Baniūkas (galbūt iš slaviško vardo Banas). Dažniausia Lietuvoje – Šiaulių apskrityje. Žymiausias jos turėtojas – Gintautas Baniūkštis (g. 1960 m.), politikas, buvęs LR sveikatos apsaugos viceministras ir Šiaulių miesto savivaldybės administracijos direktorius.