Lietuviška pavardė „Apinaitis“ yra kilusi iš žodžio apynys (vynuogė) arba apynė (vynuogynas), nurodant asmens ryšį su šiais augalais – galbūt augintoją, savininką ar gyvenamą vietą. Tai yra toponiminė (kilusi iš vietovardžio) pavardė.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Kazys Apinaitis (1904–1990) – Lietuvos skulptorius, kurio darbai saugomi nacionaliniuose muziejuose.
Antanas Apinaitis (g. 1937) – inžinierius, visuomenės veikėjas išeivijoje (JAV).