Lietuviška pavardė „Žydonis“ kilusi iš žodžio „žydėti“ – galbūt tiesiogiai susijusi su žydinčiu augalu, žydėjimu ar spalva (pvz., žalia, žydra). Gali reikšti „žydinčio žmogų“ arba būti susijusi su gamtos reiškiniu.
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
- Kazys Žydonis (1935–2020) – Lietuvos skulptorius, sukūręs daugiau nei 200 monumentų ir memorialų.
- Stasys Žydonis (g. 1945) – Lietuvos ir JAV filosofas, vertėjas, humanitarinių mokslų daktaras.