Pavardė „Žemaitaitis“ kilusi iš žodžio „žemaitis“, nusakančio Žemaitijos gyventoją. Priesaga „-aitis“ dažnai reiškia kilmę ar priklausymą, taigi pavardė galėtų rodyti asmens ar jo protėvių ryšį su Žemaitijos regionu.
Istoriniuose šaltiniuose minimas Jonas Žemaitaitis (apie 1383–1442), vienas pirmųjų žinomų Lietuvos kariuomenės vadavų, dalyvavęs kovose su kryžiuočiais. Šiuolaikiniame kontekste pavardę turi karininkas ir rezistencijos dalyvis Juozas Lukša-Žemaitaitis (1921–1951), vienas žymiausių Lietuvos partizanų, pasirašinėjęs šiuo pseudonimu.