Lietuviškos kilmės pavardė, kilusi iš žodžio „zaperas“ (žemdirbys, dirbantis užperėje – už upės). Gali būti susijusi su vietovardžiais (pvz., Zaperėjai). Žymiausias jos turėtojas – Marius Zapereckas (g. 1974 m.), Lietuvos verslininkas, investuotojas, žinomas kaip „Vilniaus Prekybos“ savininkas ir vienas turtingiausių šalies žmonių.