Lietuviška pavardė „Zakalskis“ yra kilusi iš žodžio zakala – tai buvo žemės ar miško atkarpa, atskirta nuo pagrindinio ploto. Pavardė galėjo rodyti, kad asmuo gyveno ar valdė tokią atskirą žemės dalį. Gali būti ir susijusi su vietovardžiais (pvz., kaimo pavadinimais).
Istoriniuose šaltiniuose minimas kunigas Jonas Zakalskis (XIX a. pabaiga – XX a. pradžia), veikęs Šiaurės Lietuvoje. Šiuolaikinių plačiai žinomų asmenų su šia pavarde nėra. Pavardė gana reta, bet išlikusi kaip kultūrinės ir istorinės kilmės liudininkė.