Lietuviška pavardė „Vaikėnas“ kilusi iš žodžio vaikas, galbūt žymint žmogų, turėjusį daug vaikų, arba jauną, vaikišką asmenį. Istoriškai tokios pavardės galėjo kilti kaip pravardės.
Žymūs žmonės:
- Marius Vaikėnas – Lietuvos futbolininkas, rungtyniavęs gynėjo pozicijoje.
- Jonas Vaikėnas – kunigas, visuomenės veikėjas, aktyvus XIX a. pabaigoje – XX a. pradžioje.
Pavardė dažniausia Lietuvoje, ypač Žemaitijoje.