"Vagenis" – lietuviška pavardė, kilusi iš žodžio vagis (plg. vogti). Ji nurodo vagies, vogtuvio profesiją arba ypatybę, tipiška daugeliui lietuviškų pavardžių, susijusių su veikla ar charakteriu.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
- Algirdas Vagenis – choro dirigentas, pedagogas.
- Henrikas Vagenis – ekonomistas, politikas, buvęs LR finansų ministras.
- Kazys Vagenis – tautodailininkas, medžio drožėjas.