Pavardė „Užupis“ kilusi iš vietovardžių, reiškianti gyvenvietę už upės arba užtvindytą vietą. Garsiausias jos nešiotojas – Vilniaus dailininkas ir poetas Romas Užupis, vienas iš respublikos Užupio steigėjų. Pavardę taip pat turi krepšininkas Dominykas Užupis.