Lietuviška pavardė, kilusi iš žodžio „šmulkštus“ – smulkus, nedidelis, menkas. Gali būti susijusi su nedidelio ūgio, liekno žmogaus pravarde. Istorijoje žymių asmenų su šia pavardė nėra daug, tačiau ją turėjo Antanas Šmulkštys (g. 1939 m.) – Lietuvos skulptorius, medžio drožėjas, kūręs tradicinę sakralinę ir tautodinę skulptūrą.