Lietuviškos pavardės „Širkulis“ kilmė siejama su žodžiu „širklys“ (šnek. – „širdžius, širdžių ligonis“) arba su veiksmažodžiu „širkti“ (reikšmėmis „šnypšti, šlamėti“ arba „raitytis“). Tai gana reta pavardė.
Įžymiausias jos turėtojas – Robertas Širkulis (g. 1994 m.), Lietuvos futbolininkas (saugas), žaidęs nacionalinėje rinktinėje ir užsienio klubuose. Kitas žinomas asmuo – Juozas Širkulis (1935–2018), inžinierius, habilituotas technologijos mokslų daktaras.