Lietuviška pavardė, kilusi iš žodžio „šipkas“ (pušies jauniklis, spygliuotis). Gali būti kilusi iš asmenvardžio Šipkus. Žymiausias – krepšininkas Kęstutis Šipkauskas, žaidęs Kauno „Žalgiryje“ ir Lietuvos rinktinėje. Taip pat aktorius Gintaras Šipkauskas ir dailininkas Algimantas Šipkauskas.