Lietuviška pavardė, kilusi iš asmenvardžio Šimilis (iš Šimys, trumpinys nuo Šimantas arba Simonas). Galūnė -ūnas rodo kilimą, t. y. reiškia „iš Šimilio šeimos“ arba „Šimilio sūnus“.
Įžymūs žmonės:
Arūnas Šimiliūnas – verslininkas, seniausias Lietuvoje radijo stoties „M-1“ įkūrėjas.
Stasys Šimiliūnas – choro dirigentas, pedagogas.
Vladas Šimiliūnas – architektas, visuomenės veikėjas.
Pavardė paplitusi Lietuvoje, ypač Aukštaitijos regione.