Lietuviška pavardė, kilusi iš žodžio „šilkas“ (audinys arba šilko gamybos amatas). Gali būti susijusi su šilkininkų arba šilko prekybos užsiėmimu. Istoriškai paplitusi Lietuvoje.
Įžymūs žmonės:
- Algirdas Šilkaitis – choro dirigentas, pedagogas.
- Vladas Šilkaitis – aktorius, režisierius.
- Juozas Šilkaitis – kunigas, visuomenės veikėjas, tremtyje leidęs lietuvišką spaudą.