Uzvārds "Šarkūnas" ir baltu izcelsmes, visbiežāk sastopams Lietuvā. Tas cēlies no lietuviešu vārda "šarkūnas", kas apzīmē "ziloni" vai "zilgalvīti" — mazu dziedātājputnu. Lietuviešu onomastikā šādi uzvārdi bieži veidojušies no dzīvnieku, augu vai dabas parādību nosaukumiem.
Slaveni cilvēki ar šo uzvārdu:
1. Andrius Šarkūnas — Lietuvas mākslinieks un gleznotājs.
2. Vladimiras Šarkūnas — padomju laika Lietuvas futbolists.
3. Šarkūnu dzimta — vēsturiski minēta Lietuvas aristokrātijā.
Uzvārds galvenokārt koncentrēts Baltijas reģionā, īpaši Lietuvā, un atspoguļo senas lietuviešu uzvārdu veidošanas tradīcijas, kas balstītas uz dabas motīviem.