Pavardė „Šalkauskas“ yra lietuviška, kilusi iš asmenvardžio Šalka, galimai siejamo su žodžiu „šalikas“ (palaikovas, bendražygis) arba „šalksna“ (drebule). Tai patroniminė pavardė, reiškianti „Šalkos sūnus“.
Įžymūs pavadėje:
- Stasys Šalkauskis (1886–1941) – filosofas, pedagogas, Kauno universiteto rektorius.
- Vincas Šalkauskis (g. 1953) – politikas, buvęs LR socialinės apsaugos ministras.
- Pranas Šalkauskas (1895–1959) – agronomas, žemės ūkio specialistas.
Pavardė dažniausia Lietuvoje, ypač Žemaitijoje.