Lietuviška pavardė „Šaikūnas“ yra kilusi iš žodžio šaika, reiškiančio 'šakelę, šaką, kuokštą'. Tai buvo priesagos -ūnas darinys, galbūt nusakęs žmogų, dirbusį su šakomis (pvz., pynė pintines), arba gyvenusį šakotoje, tankioje vietoje.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Jonas Šaikūnas – žurnalistas, redaktorius, visuomenės veikėjas.
Kazimieras Šaikūnas – agronomas, žemės ūkio organizatorius.
Vytautas Šaikūnas – architektas, projektavęs daug pastatų Vilniuje (pvz., buvusį LKP CK rūmų pastatą).
Mindaugas Šaikūnas – dailininkas, skulptorius.
Trumpai: pavardė siejama su šakomis, o garsiausi jos turėtojai – žurnalistas Jonas, architektas Vytautas ir dailininkas Mindaugas Šaikūnas.