Lietuviška pavardė „Rukšėnas“ kilusi iš žodžio rukšė – senovinis terminas, reiškiantis rugių javus, rugių lauką. Tai buvusi asmeninė arba vietinė charakteristika, galėjusi nurodyti žmogų, gyvenantį prie rugių lauko, ar užsiimantį rugių auginimu.
Žymūs žmonės:
- Mindaugas Rukšėnas – politikas, buvęs Šakių rajono meras.
- Algirdas Rukšėnas – žinomas Lietuvos architektas.
- Jonas Rukšėnas – dailininkas, tapytojas.
Pavardė paplitusi daugiausia Lietuvoje, ypač vakarinėje dalyje (Suvalkijoje, Žemaitijoje).