Lietuviškos pavardės „Rugenis“ kilusios iš žodžio rugys (javas). Ji galėjo įvardyti žmogų, dirbusį rugių lauke, auginusį rugius arba gyvenusį prie rugių lauko.
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
Kazys Rugys (1906–1991) – Lietuvos skulptorius.
Povilas Rugys (g. 1952) – Lietuvos politikas, buvęs LR socialinės apsaugos ir darbo ministras.
Ričardas Rugys (g. 1973) – Lietuvos verslininkas, investuotojas, kino prodiuseris.