Pavardė „Putinaitis“ yra lietuviška, sudaryta iš rusų pavardės „Putin“ ir lietuviško priesagos „-aitis“, nurodančios sūnų arba kilmę. Ji gali reikšti „Putino sūnus“ arba asmenį, susijusį su Putinu (dažniausiai Vladimiru Putinu). Lietuvoje ši pavardė reta, tačiau žinomiausias jos turėtojas yra Vladimiras Putinaitis (g. 1961 m.) – Lietuvos politikas, buvęs LR socialinės apsaugos ir darbo ministras, Seimo narys.