Lietuviška pavardė „Pratkus“ yra kilusi iš žodžio „pratkti“ (pratkęsti, pratkinimas), reiškiančio gerti, siurbti skystį. Tai galėjo būti pravardinės kilmės, sietina su asmeniu, kuris mėgo gerti arba dirbo susijusiu darbu.
Istoriniuose šaltiniuose minimas Mikalojus Pratkus, XVI a. LDK valstybinis veikėjas, Vitebsko pakamaris. Šiuolaikinių žymių žmonių su šia pavarde nėra plačiai žinoma.