Pavardė „Pipinis“ yra lietuviška, greičiausiai kilusi iš žodžio „pipinas“, kuris reiškia agurką arba ridikėlį. Tai galėjo būti pravardinės kilmės, sietina su daržininkyste ar tam tikrais asmeniniais bruožais.
Žymiausias jos turėtojas – Kazys Pipinis (1893–1941), Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas, aktyvus dalyvis nepriklausomybės kovose.