Ši pavardė yra lietuviška, kilusi iš žodžio „gžiobuti“ – tai veiksmažodis, reiškiantis „glostyti, leisti rankas“. Pavardė atsirado kaip pravardė, galbūt nusakanti švelnų, rūpestingą žmogų.
Istorijoje žinomiausias šios pavardės asmuo yra Adomas Gčiobutas (1810–1886) – vienuolis, pranciškonas, visuomenės veikėjas ir rašytojas, aktyviai dalyvavęs XIX a. lietuvių tautiniame atgimime.