Lietuviškos kilmės pavardė, dažniausiai siejama su vardu Petras. Galimi variantai – „Petkaus“ arba „Petkūno“ sūnus, taip pat gali kilti iš žodžio „petkus“ (šnek. – smulkus, menkas). Istoriniuose šaltiniuose minima nuo XVI a. Žymiausi jos turėtojai:
- Mikalojus Kazimieras Petkūnas (XIX a. pab. – XX a. pr.) – kunigas, visuomenės veikėjas, vienas iš „Aušros“ leidėjų.
- Pranas Petkūnas (1905–1989) – poetas, vertėjas.
- Petkūnai kaip giminė – LDK bajorai, turėję dvarų Lietuvoje.
Ši pavardė yra gana reta, bet turi istorinio svorio.