Pavardė „Pepolis“ yra lietuviška, greičiausiai kilusi iš žodžio pepaluoti (šnek. – plakti, mušti) arba iš pravardės, nurodančios stiprų, tvirtą žmogų. Tai gana reta pavardė.
Įžymiausias jos turėtojas – Juozas Pepolis (1874–1926), Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas, vienas Lietuvos kariuomenės kūrėjų.