Lietuviškos pavardės „Pauparys“ kilmė siejama su vietovardžiais, kuriuose minimas upės krantas (pa- + upė + -arys). Tai galėjo rodyti gyvenamąją vietą prie upės arba žmogų, atvykusį iš tokios vietos.
Istorijoje žymiausias šios pavardės žmogus yra Jonas Pauparys (1895–1966) – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas, aktyvus dalyvis nepriklausomybės kovose.
Trumpai: pavardė kilusi iš žodžių, susijusių su upės krantu, o žymiausias jos turėtojas – pulkininkas Jonas Pauparys.