Pavardė „Patupis“ – lietuviška, kilusi iš upėvardžio. Gali būti susijusi su gyvenviete prie upės ar patvankos. Žymiausias jos turėtojas – poetas, vertėjas Kazys Patupis (1909–1950), žinomas eilėraščiu „Pavasario giesmė“. Pavardę taip pat turėjo kelios literatūros ir kultūros veikėjos XX amžiuje.