Pavardė „Pagojus“ yra kilusi iš vietovardžio, reiškiančio gyvenvietę pagojuje – miško pakraštyje arba už jo. Lietuvoje žinomi šios pavardės žmonės yra aktorius ir režisierius Rolandas Pagojus, taip pat jo sūnus aktorius Kazimieras Pagojus.