Kilminga pavardė „Pagirnius“ yra kilusi iš žodžių „pa-“ (prie) ir „girnius“ (girna, malūno akmuo), tad ji gali rodyti gyvenamą vietą prie girnų ar malūno. Lietuvoje žinomi šios pavardės žmonės:
Jonas Pagirnius – poetas, vertėjas.
Petras Pagirnius – agronomas, visuomenės veikėjas.
Vladas Pagirnius – architektas.
Pavardė dažniausia Utenos ir Zarasų rajonuose.