Lietuviška pavardė „Nikžentaitis“ yra kilusi iš asmenvardžio Nikžentas, kuris savo ruožtu siejasi su baltišku vardu Nikšas ar Nikšius. Galūnė „-aitis“ nurodo sūnų arba kilmę, taigi pavardė reiškia „Nikšento (arba Nikšo) sūnus“. Tai yra patroniminė (iš tėvo vardo sudaryta) pavardė, būdinga lietuvių kalbei.
Žymiausias jos nešiotojas – Alvydas Nikžentaitis (g. 1961 m.), istorikas, Lietuvos istorijos instituto mokslo darbuotojas, daugelio darbų apie Lietuvos viduramžius ir atminties kultūrą autorius.