Lietuviška pavardė, kilusi iš Nemunaičio (Nemunaitis) – kaimo pietų Lietuvoje, prie Nemuno upės. Tai vietovardinis kilmės ženklas, rodantis asmens ar jo protėvių ryšį su ta vieta.
Įžymūs žmonės:
Kazys Nemunaitis (1904–1974) – Romos katalikų kunigas, visuomenės veikėjas, tremtinys.
Algirdas Nemunaitis (g. 1932) – ekonomistas, habilituotas socialinių mokslų daktaras.
Julius Nemunaitis (g. 1947) – onkologas chirurgas, dirbęs JAV, vienas geriausiai Lietuvoje pažįstamų šios srities mokslininkų.