Pavardė „Nauburaitis“ yra lietuviška, kilusi iš asmenvardžio Nauburas (galbūt iš vokiško „Neuberger“ ar panašaus). Ji reiškia „Nauburo sūnus“ arba „kilęs iš Nauburo“. Ši pavardė gana reta, nėra plačiai žinomų asmenų, ją turinčių. Istoriniuose šaltiniuose sutinkami pavieniai nešiotojai, pavyzdžiui, XIX a. pabaigos – XX a. pradžios knygnešys Jonas Nauburaitis, taip pat keli dvasininkai ar ūkininkai, bet jie nėra visuomenėje plačiai žinomi. Pavardė dažniausia aptinkama Lietuvos vakaruose, ypač Klaipėdos krašte.