Pavardė „Muškauskis“ yra lietuviška, kilusi iš asmenvardžio „Muškauskas“, o šis – iš krikšto vardo Motiejus (lot. Matthias). Tai patroniminė pavardė, rodanti sūnų arba palikuonį iš Muškausko (Motiejaus). Lietuvoje tokios pavardės paplitusios, ypač Aukštaitijoje.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
- Kazys Muškauskis (g. 1950 m.) – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
- Stasys Muškauskis (g. 1949 m.) – Lietuvos žurnalistas, redaktorius.
- Vladas Muškauskis (1895–1965) – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Trumpai: pavardė kilusi iš vardo Motiejus, žinomi veikėjai – kariniai ir kultūriniai veikėjai.