Pavardė „Molys“ kilusi iš lietuvių žodžio „molis“ (dirvožemis, lipni žemė). Ji gali būti susijusi su žemės ūkiu, keramika ar gyvenamąja vieta molinguose plotuose. Žymiausias jos turėtojas – prancūzų futbolininkas Benoît Molis, žaidęs Prancūzijos ir Kipro klubuose. Lietuvoje ši pavardė nėra plačiai paplitusi, tačiau aptinkama kaip vietovardinis ar profesinis pavadinimas.