Tai lietuviška moteriška pavardė, kilusi iš vyriškos formos „Misiūnas“. Ji nurodo buvusią ar dabartinę šeimos padėtį – tai yra Misiūno žmona ar našlė. Pavardė atspindi tradicinį lietuvių pavardžių darybos būdą, kai prie vyriškos pavardės pridedami priesagai „-ienė“.
Žymiausias asmuo su šia pavardė – Dalia Misiūnienė, Lietuvos irkluotoja, olimpietė ir daugkartinė medalinkė.