Pavardė „Mikalojūnas“ yra patroniminė, kilusi iš vardo Mikalojus (lotyniškas Nicolaus). Ji nurodo „Mikalojo sūnus“. Lietuvių kalboje tokios pavardės dažniausiai susidarė prieš kelis šimtmečius.
Žymiausi asmenys su šia pavardė:
Konstantinas Mikalojūnas – žinomas Lietuvos ir Rusijos tapytojas, XIX a. realistinės dailės atstovas.
Justinas Mikalojūnas – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Vladas Mikalojūnas – Lietuvos architektas.
Trumpai tariant, tai – iš vardo Mikalojus kilusi lietuviška pavardė, kurią turėjo keli žymių menininkų ir visuomenės veikėjų.