Pavardė „Mekšriūnas“ yra kilusi iš žodžio mekšras – tai senas lietuviškas terminas, reiškiantis vandens telkinio dugno įdubą, gilią vietą upėje ar ežere (panašiai kaip duobė ar dauba). Pavardė greičiausiai žymi žmogų, gyvenusį prie tokios vietos, arba turėjusi pravardinę kilmę.
Iš šios pavardės žinomiausi asmenys yra:
Kazys Mekšriūnas (1907–1980) – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Juozas Mekšriūnas (g. 1935) – agronomas ir visuomenės veikėjas JAV lietuvių bendruomenėje.
Trumpai tariant – tai vietomis kilusi pavardė, susijusi su vandens telkinio ypatybe, ir turinti keletą žymesnių atstovų Lietuvos istorijoje bei išeivijoje.