Lietuviška pavardė „Matarūnas“ yra kilusi iš žodžio matarūnas, kuris reiškia didžiulį, milžinišką, stambų žmogų arba milžiną. Tai buvo pravardinės kilmės pavardė, galėjusi atspindėti asmens fizinį išvaizdą ar charakterį.
Žymiausi žmonės su šia pavardė:
Kazimieras Matarūnas – Lietuvos partizanas, rezistentas.
Stasys Matarūnas – Lietuvos kalbininkas, vertėjas, humanitarinių mokslų daktaras.
Pavardė dažniausia Lietuvoje, ypač Utenos ir Vilniaus kraštuose.