Lietuviška pavardė „Markšys“ yra kilusi iš vardo „Markus“ (lotyniškas „Marcus“) trumpinių arba pravardžių. Tai patroniminė pavardė, reiškianti „Markaus sūnus“ arba „iš Markaus (giminės)“.
Įžymūs žmonės su šia pavardė:
Kęstutis Markšys – Lietuvos irkluotojas, olimpietis.
Stasys Markšys – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Vytautas Markšys – choro dirigentas ir pedagogas.
Trumpai: pavardė kilusi iš vardo Markus, žinomi sportininkai, karininkai, menininkai.