Pavardė „Markaitis“ yra lietuviška, kilusi iš vardo Markas (lot. Marcus), su priesaga -aitis, nurodančia sūnų arba kilimą. Tai patroniminė pavardė, reiškianti „Marko sūnus“.
Įžymūs žmonės:
- Mindaugas Markaitis – teisininkas, LR Konstitucinio Teismo pirmininkas.
- Skaidrė Marčaitė-Markaitienė – kalbininkė, humanitarinių mokslų daktarė.
- Arūnas Markaitis – krepšininkas, treneris.
- Algirdas Markaitis – politikas, buvęs LR sveikatos apsaugos viceministras.