Tai lietuviška patroniminė pavardė, kilusi iš vardo Martynas (lot. Martinus). Ji reiškia „Martyno sūnus“ arba „iš Martyno (giminės)“.
Įžymūs žmonės su šia pavarde:
Stasys Marcinkėnas – Lietuvos karinis veikėjas, pulkininkas.
Kazimieras Marcinkėnas – kunigas, visuomenės veikėjas, politinis kalinys.
Juozas Marcinkėnas – poetas, vertėjas.
Jonas Marcinkėnas – choro dirigentas, pedagogas.
Pavardė dažniausia Lietuvoje, ypač Utenos ir Vilniaus apskrityse.